Isotonic Regression

Tracking Pango lineages by name

Options

Pango lineage designation
in GISAID

Test		Background
			If the test set is a subset of the background set, the frequency of the test set within the background set will be compared over time (e.g. BA.2 (test) within all Omicrons (background)). If the test set is not in the background set, the frequency of test set will be compared to the combination (e.g. Delta (test) within [Delta (test)+Omicron (background]).

Assumption

Test lingeages are increasing decreasing over time

Filter by

collection date	-
host

Geographic level

last modified: Tue Jan 18 18:24 2022

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Alpha (B.1.1.7 and Q.*)
Delta (B.1.617.2 and AY.*)
Epsilon (B.1.429 and B.1.427)
Gamma (P.1 and P.1.*)
Lambda (C.37 and C.37.*)
Mu (B.1.621 and B.1.621.*)
Omicron (B.1.1.529 and BA.*)
B.1.1.318 (B.1.1.318 and AZ.*)
───────────────────
A
A.1
A.11
A.12
A.15
A.16
A.17
A.18
A.19
A.2
A.2.2
A.2.3
A.2.4
A.2.5
A.2.5.1
A.2.5.2
A.2.5.3
A.21
A.22
A.23
A.23.1
A.24
A.25
A.26
A.27
A.28
A.29
A.3
A.30
A.4
A.5
A.6
A.7
A.9
AA.1
AA.2
AA.3
AA.4
AA.5
AA.6
AA.7
AA.8
AB.1
AC.1
AD.1
AD.2
AD.2.1
AE.1
AE.2
AE.3
AE.4
AE.5
AE.6
AE.7
AE.8
AF.1
AG.1
AH.1
AH.2
AH.3
AJ.1
AK.1
AK.2
AL.1
AM.1
AM.2
AM.3
AM.4
AN.1
AP.1
AQ.1
AQ.2
AS.1
AS.2
AT.1
AU.1
AU.2
AU.3
AV.1
AW.1
AY.1 (Delta)
AY.10 (Delta)
AY.100 (Delta)
AY.101 (Delta)
AY.102 (Delta)
AY.102.1 (Delta)
AY.102.2 (Delta)
AY.103 (Delta)
AY.104 (Delta)
AY.105 (Delta)
AY.106 (Delta)
AY.107 (Delta)
AY.108 (Delta)
AY.109 (Delta)
AY.11 (Delta)
AY.110 (Delta)
AY.111 (Delta)
AY.112 (Delta)
AY.112.1 (Delta)
AY.113 (Delta)
AY.114 (Delta)
AY.116 (Delta)
AY.116.1 (Delta)
AY.117 (Delta)
AY.118 (Delta)
AY.119 (Delta)
AY.119.1 (Delta)
AY.119.2 (Delta)
AY.120 (Delta)
AY.120.1 (Delta)
AY.120.2 (Delta)
AY.120.2.1 (Delta)
AY.121 (Delta)
AY.121.1 (Delta)
AY.122 (Delta)
AY.122.1 (Delta)
AY.122.2 (Delta)
AY.122.3 (Delta)
AY.123 (Delta)
AY.123.1 (Delta)
AY.124 (Delta)
AY.124.1 (Delta)
AY.125 (Delta)
AY.126 (Delta)
AY.127 (Delta)
AY.127.1 (Delta)
AY.128 (Delta)
AY.129 (Delta)
AY.13 (Delta)
AY.131 (Delta)
AY.132 (Delta)
AY.133 (Delta)
AY.14 (Delta)
AY.15 (Delta)
AY.16 (Delta)
AY.16.1 (Delta)
AY.17 (Delta)
AY.18 (Delta)
AY.19 (Delta)
AY.2 (Delta)
AY.20 (Delta)
AY.20.1 (Delta)
AY.21 (Delta)
AY.22 (Delta)
AY.23 (Delta)
AY.23.1 (Delta)
AY.23.2 (Delta)
AY.24 (Delta)
AY.25 (Delta)
AY.25.1 (Delta)
AY.25.1.1 (Delta)
AY.26 (Delta)
AY.26.1 (Delta)
AY.27 (Delta)
AY.28 (Delta)
AY.29 (Delta)
AY.29.1 (Delta)
AY.3 (Delta)
AY.3.1 (Delta)
AY.3.2 (Delta)
AY.3.3 (Delta)
AY.30 (Delta)
AY.31 (Delta)
AY.32 (Delta)
AY.33 (Delta)
AY.33.1 (Delta)
AY.34 (Delta)
AY.34.1 (Delta)
AY.34.1.1 (Delta)
AY.34.2 (Delta)
AY.35 (Delta)
AY.36 (Delta)
AY.37 (Delta)
AY.38 (Delta)
AY.39 (Delta)
AY.39.1 (Delta)
AY.39.1.1 (Delta)
AY.39.1.2 (Delta)
AY.39.1.3 (Delta)
AY.39.2 (Delta)
AY.4 (Delta)
AY.4.1 (Delta)
AY.4.10 (Delta)
AY.4.2 (Delta)
AY.4.2.1 (Delta)
AY.4.2.2 (Delta)
AY.4.2.3 (Delta)
AY.4.3 (Delta)
AY.4.4 (Delta)
AY.4.5 (Delta)
AY.4.6 (Delta)
AY.4.7 (Delta)
AY.4.8 (Delta)
AY.4.9 (Delta)
AY.40 (Delta)
AY.41 (Delta)
AY.42 (Delta)
AY.42.1 (Delta)
AY.43 (Delta)
AY.43.1 (Delta)
AY.43.2 (Delta)
AY.43.3 (Delta)
AY.43.4 (Delta)
AY.43.5 (Delta)
AY.43.6 (Delta)
AY.43.7 (Delta)
AY.44 (Delta)
AY.45 (Delta)
AY.46 (Delta)
AY.46.1 (Delta)
AY.46.2 (Delta)
AY.46.3 (Delta)
AY.46.4 (Delta)
AY.46.5 (Delta)
AY.46.6 (Delta)
AY.46.6.1 (Delta)
AY.47 (Delta)
AY.48 (Delta)
AY.49 (Delta)
AY.5 (Delta)
AY.5.1 (Delta)
AY.5.2 (Delta)
AY.5.3 (Delta)
AY.5.4 (Delta)
AY.5.5 (Delta)
AY.50 (Delta)
AY.51 (Delta)
AY.52 (Delta)
AY.53 (Delta)
AY.54 (Delta)
AY.55 (Delta)
AY.56 (Delta)
AY.57 (Delta)
AY.58 (Delta)
AY.59 (Delta)
AY.6 (Delta)
AY.60 (Delta)
AY.61 (Delta)
AY.62 (Delta)
AY.63 (Delta)
AY.64 (Delta)
AY.65 (Delta)
AY.66 (Delta)
AY.67 (Delta)
AY.68 (Delta)
AY.69 (Delta)
AY.7 (Delta)
AY.7.1 (Delta)
AY.7.2 (Delta)
AY.70 (Delta)
AY.71 (Delta)
AY.72 (Delta)
AY.73 (Delta)
AY.74 (Delta)
AY.75 (Delta)
AY.75.2 (Delta)
AY.75.3 (Delta)
AY.76 (Delta)
AY.77 (Delta)
AY.78 (Delta)
AY.79 (Delta)
AY.8 (Delta)
AY.80 (Delta)
AY.81 (Delta)
AY.82 (Delta)
AY.83 (Delta)
AY.84 (Delta)
AY.85 (Delta)
AY.86 (Delta)
AY.87 (Delta)
AY.88 (Delta)
AY.89 (Delta)
AY.9 (Delta)
AY.9.2 (Delta)
AY.9.2.1 (Delta)
AY.9.2.2 (Delta)
AY.90 (Delta)
AY.91 (Delta)
AY.91.1 (Delta)
AY.92 (Delta)
AY.93 (Delta)
AY.94 (Delta)
AY.95 (Delta)
AY.96 (Delta)
AY.98 (Delta)
AY.98.1 (Delta)
AY.99 (Delta)
AY.99.1 (Delta)
AY.99.2 (Delta)
AZ.1 (B.1.1.318AZ)
AZ.2 (B.1.1.318AZ)
AZ.2.1 (B.1.1.318AZ)
AZ.3 (B.1.1.318AZ)
AZ.4 (B.1.1.318AZ)
AZ.5 (B.1.1.318AZ)
AZ.6 (B.1.1.318AZ)
B
B.1
B.1.1
B.1.1.1
B.1.1.10
B.1.1.100
B.1.1.101
B.1.1.107
B.1.1.109
B.1.1.110
B.1.1.111
B.1.1.112
B.1.1.113
B.1.1.114
B.1.1.115
B.1.1.116
B.1.1.117
B.1.1.118
B.1.1.119
B.1.1.12
B.1.1.120
B.1.1.121
B.1.1.122
B.1.1.123
B.1.1.125
B.1.1.127
B.1.1.128
B.1.1.129
B.1.1.13
B.1.1.130
B.1.1.132
B.1.1.133
B.1.1.134
B.1.1.135
B.1.1.136
B.1.1.137
B.1.1.138
B.1.1.139
B.1.1.14
B.1.1.141
B.1.1.142
B.1.1.144
B.1.1.145
B.1.1.147
B.1.1.148
B.1.1.149
B.1.1.15
B.1.1.152
B.1.1.153
B.1.1.154
B.1.1.155
B.1.1.157
B.1.1.158
B.1.1.159
B.1.1.16
B.1.1.160
B.1.1.161
B.1.1.162
B.1.1.163
B.1.1.164
B.1.1.165
B.1.1.166
B.1.1.168
B.1.1.169
B.1.1.17
B.1.1.170
B.1.1.171
B.1.1.172
B.1.1.174
B.1.1.175
B.1.1.176
B.1.1.177
B.1.1.178
B.1.1.180
B.1.1.181
B.1.1.182
B.1.1.184
B.1.1.185
B.1.1.186
B.1.1.187
B.1.1.189
B.1.1.190
B.1.1.191
B.1.1.192
B.1.1.193
B.1.1.194
B.1.1.196
B.1.1.197
B.1.1.198
B.1.1.200
B.1.1.201
B.1.1.202
B.1.1.203
B.1.1.204
B.1.1.205
B.1.1.207
B.1.1.208
B.1.1.209
B.1.1.210
B.1.1.213
B.1.1.214
B.1.1.216
B.1.1.217
B.1.1.218
B.1.1.219
B.1.1.220
B.1.1.221
B.1.1.222
B.1.1.224
B.1.1.225
B.1.1.226
B.1.1.227
B.1.1.228
B.1.1.229
B.1.1.230
B.1.1.231
B.1.1.232
B.1.1.234
B.1.1.236
B.1.1.237
B.1.1.239
B.1.1.240
B.1.1.241
B.1.1.242
B.1.1.243
B.1.1.244
B.1.1.249
B.1.1.25
B.1.1.251
B.1.1.253
B.1.1.254
B.1.1.255
B.1.1.256
B.1.1.257
B.1.1.258
B.1.1.26
B.1.1.261
B.1.1.262
B.1.1.263
B.1.1.265
B.1.1.266
B.1.1.267
B.1.1.268
B.1.1.269
B.1.1.27
B.1.1.270
B.1.1.271
B.1.1.272
B.1.1.273
B.1.1.274
B.1.1.275
B.1.1.277
B.1.1.279
B.1.1.28
B.1.1.280
B.1.1.282
B.1.1.283
B.1.1.284
B.1.1.285
B.1.1.286
B.1.1.288
B.1.1.289
B.1.1.29
B.1.1.290
B.1.1.291
B.1.1.294
B.1.1.296
B.1.1.297
B.1.1.298
B.1.1.299
B.1.1.3
B.1.1.30
B.1.1.300
B.1.1.301
B.1.1.302
B.1.1.303
B.1.1.304
B.1.1.305
B.1.1.306
B.1.1.307
B.1.1.308
B.1.1.309
B.1.1.31
B.1.1.310
B.1.1.311
B.1.1.312
B.1.1.315
B.1.1.316
B.1.1.317
B.1.1.318 (B.1.1.318AZ)
B.1.1.319
B.1.1.320
B.1.1.322
B.1.1.323
B.1.1.324
B.1.1.325
B.1.1.326
B.1.1.327
B.1.1.328
B.1.1.329
B.1.1.33
B.1.1.330
B.1.1.331
B.1.1.332
B.1.1.333
B.1.1.334
B.1.1.335
B.1.1.336
B.1.1.337
B.1.1.338
B.1.1.339
B.1.1.34
B.1.1.340
B.1.1.341
B.1.1.342
B.1.1.343
B.1.1.344
B.1.1.345
B.1.1.346
B.1.1.347
B.1.1.348
B.1.1.349
B.1.1.350
B.1.1.351
B.1.1.352
B.1.1.353
B.1.1.354
B.1.1.355
B.1.1.356
B.1.1.357
B.1.1.358
B.1.1.359
B.1.1.360
B.1.1.361
B.1.1.362
B.1.1.363
B.1.1.364
B.1.1.365
B.1.1.366
B.1.1.367
B.1.1.368
B.1.1.369
B.1.1.37
B.1.1.370
B.1.1.371
B.1.1.372
B.1.1.373
B.1.1.374
B.1.1.375
B.1.1.376
B.1.1.377
B.1.1.378
B.1.1.379
B.1.1.38
B.1.1.380
B.1.1.381
B.1.1.382
B.1.1.383
B.1.1.384
B.1.1.385
B.1.1.386
B.1.1.387
B.1.1.388
B.1.1.389
B.1.1.39
B.1.1.391
B.1.1.392
B.1.1.393
B.1.1.394
B.1.1.395
B.1.1.396
B.1.1.397
B.1.1.398
B.1.1.399
B.1.1.4
B.1.1.40
B.1.1.400
B.1.1.401
B.1.1.402
B.1.1.403
B.1.1.404
B.1.1.405
B.1.1.406
B.1.1.407
B.1.1.408
B.1.1.409
B.1.1.41
B.1.1.410
B.1.1.411
B.1.1.412
B.1.1.413
B.1.1.414
B.1.1.415
B.1.1.416
B.1.1.417
B.1.1.418
B.1.1.419
B.1.1.420
B.1.1.421
B.1.1.422
B.1.1.423
B.1.1.424
B.1.1.425
B.1.1.426
B.1.1.427
B.1.1.428
B.1.1.429
B.1.1.43
B.1.1.430
B.1.1.431
B.1.1.432
B.1.1.433
B.1.1.434
B.1.1.435
B.1.1.436
B.1.1.437
B.1.1.438
B.1.1.44
B.1.1.440
B.1.1.441
B.1.1.442
B.1.1.444
B.1.1.445
B.1.1.446
B.1.1.447
B.1.1.448
B.1.1.449
B.1.1.45
B.1.1.450
B.1.1.451
B.1.1.452
B.1.1.453
B.1.1.456
B.1.1.458
B.1.1.459
B.1.1.46
B.1.1.461
B.1.1.462
B.1.1.463
B.1.1.464
B.1.1.465
B.1.1.466
B.1.1.467
B.1.1.47
B.1.1.48
B.1.1.480
B.1.1.481
B.1.1.482
B.1.1.483
B.1.1.484
B.1.1.485
B.1.1.486
B.1.1.487
B.1.1.49
B.1.1.5
B.1.1.50
B.1.1.500
B.1.1.506
B.1.1.507
B.1.1.51
B.1.1.512
B.1.1.513
B.1.1.514
B.1.1.515
B.1.1.516
B.1.1.517
B.1.1.518
B.1.1.519
B.1.1.52
B.1.1.521
B.1.1.522
B.1.1.523
B.1.1.524
B.1.1.525
B.1.1.526
B.1.1.528
B.1.1.529 (Omicron)
B.1.1.53
B.1.1.54
B.1.1.55
B.1.1.56
B.1.1.57
B.1.1.58
B.1.1.59
B.1.1.61
B.1.1.62
B.1.1.63
B.1.1.67
B.1.1.7 (Alpha)
B.1.1.70
B.1.1.71
B.1.1.72
B.1.1.74
B.1.1.75
B.1.1.77
B.1.1.8
B.1.1.82
B.1.1.83
B.1.1.84
B.1.1.86
B.1.1.87
B.1.1.88
B.1.1.89
B.1.1.90
B.1.1.91
B.1.1.92
B.1.1.93
B.1.1.95
B.1.1.97
B.1.1.98
B.1.1.99
B.1.103
B.1.104
B.1.105
B.1.106
B.1.108
B.1.110
B.1.110.1
B.1.110.2
B.1.110.3
B.1.111
B.1.112
B.1.113
B.1.115
B.1.116
B.1.117
B.1.118
B.1.119
B.1.12
B.1.120
B.1.124
B.1.126
B.1.127
B.1.128
B.1.13
B.1.131
B.1.134
B.1.137
B.1.139
B.1.14
B.1.140
B.1.142
B.1.143
B.1.145
B.1.146
B.1.147
B.1.149
B.1.151
B.1.153
B.1.157
B.1.158
B.1.159
B.1.160
B.1.160.10
B.1.160.11
B.1.160.12
B.1.160.13
B.1.160.14
B.1.160.15
B.1.160.16
B.1.160.17
B.1.160.18
B.1.160.19
B.1.160.20
B.1.160.21
B.1.160.22
B.1.160.23
B.1.160.24
B.1.160.25
B.1.160.26
B.1.160.27
B.1.160.28
B.1.160.29
B.1.160.30
B.1.160.31
B.1.160.32
B.1.160.33
B.1.160.7
B.1.160.8
B.1.160.9
B.1.161
B.1.162
B.1.163
B.1.164
B.1.165
B.1.166
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B.1.351 (Beta)
B.1.351.1
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B.1.400
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B.1.428
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B.1.429.1
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B.1.483
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B.1.501
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B.1.524
B.1.525 (Eta)
B.1.526 (Iota)
B.1.527
B.1.528
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B.1.551
B.1.552
B.1.554
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B.1.556
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B.1.561
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B.1.564
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B.1.565
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B.1.573
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B.1.577
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B.1.579
B.1.580
B.1.581
B.1.582
B.1.585
B.1.586
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B.1.589
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B.1.595.4
B.1.596
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B.1.597
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B.1.599
B.1.6
B.1.600
B.1.601
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B.1.610
B.1.611
B.1.612
B.1.613
B.1.614
B.1.615
B.1.616
B.1.617
B.1.617.1 (Kappa)
B.1.617.2 (Delta)
B.1.617.3
B.1.618
B.1.619
B.1.619.1
B.1.620
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B.1.621.1 (Mu)
B.1.622
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B.1.631
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B.1.8
B.1.81
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B.1.9
B.1.9.1
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B.1.91
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B.1.97
B.10
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B.12
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B.15
B.18
B.19
B.20
B.23
B.26
B.27
B.28
B.29
B.3
B.3.1
B.30
B.31
B.32
B.33
B.34
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B.4
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B.44
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B.46
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B.49
B.5
B.50
B.51
B.52
B.53
B.55
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B.57
B.58
B.6
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B.6.3
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B.6.8
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BA.1 (Omicron)
BA.2 (Omicron)
BA.3 (Omicron)
BB.1
BB.2
C.1
C.1.1
C.1.2
C.10
C.11
C.12
C.13
C.14
C.16
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C.18
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C.30
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C.36.3.1
C.37 (Lambda)
C.37.1 (Lambda)
C.38
C.39
C.4
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C.5
C.6
C.7
C.8
C.9
D.2
D.3
D.4
D.5
G.1
K.1
K.2
K.3
L.1
L.2
L.3
L.4
M.1
M.2
M.3
N.1
N.10
N.2
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N.6
N.7
N.8
N.9
None
P.1 (Gamma)
P.1.1 (Gamma)
P.1.10 (Gamma)
P.1.10.1 (Gamma)
P.1.10.2 (Gamma)
P.1.11 (Gamma)
P.1.12 (Gamma)
P.1.12.1 (Gamma)
P.1.13 (Gamma)
P.1.14 (Gamma)
P.1.15 (Gamma)
P.1.16 (Gamma)
P.1.17 (Gamma)
P.1.17.1 (Gamma)
P.1.2 (Gamma)
P.1.3 (Gamma)
P.1.4 (Gamma)
P.1.5 (Gamma)
P.1.6 (Gamma)
P.1.7 (Gamma)
P.1.7.1 (Gamma)
P.1.8 (Gamma)
P.1.9 (Gamma)
P.2
P.3
P.4
P.5
P.6
P.7
Q.1 (Alpha)
Q.2 (Alpha)
Q.3 (Alpha)
Q.4 (Alpha)
Q.5 (Alpha)
Q.6 (Alpha)
Q.7 (Alpha)
Q.8 (Alpha)
R.1
R.2
S.1
U.1
U.2
U.3
V.1
V.2
W.1
W.2
W.3
W.4
XA
XB
XC
Y.1
Z.1

All
Alpha (B.1.1.7 and Q.*)
Delta (B.1.617.2 and AY.*)
Epsilon (B.1.429 and B.1.427)
Gamma (P.1 and P.1.*)
Lambda (C.37 and C.37.*)
Mu (B.1.621 and B.1.621.*)
Omicron (B.1.1.529 and BA.*)
B.1.1.318 (B.1.1.318 and AZ.*)
───────────────────
A
A.1
A.11
A.12
A.15
A.16
A.17
A.18
A.19
A.2
A.2.2
A.2.3
A.2.4
A.2.5
A.2.5.1
A.2.5.2
A.2.5.3
A.21
A.22
A.23
A.23.1
A.24
A.25
A.26
A.27
A.28
A.29
A.3
A.30
A.4
A.5
A.6
A.7
A.9
AA.1
AA.2
AA.3
AA.4
AA.5
AA.6
AA.7
AA.8
AB.1
AC.1
AD.1
AD.2
AD.2.1
AE.1
AE.2
AE.3
AE.4
AE.5
AE.6
AE.7
AE.8
AF.1
AG.1
AH.1
AH.2
AH.3
AJ.1
AK.1
AK.2
AL.1
AM.1
AM.2
AM.3
AM.4
AN.1
AP.1
AQ.1
AQ.2
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AS.2
AT.1
AU.1
AU.2
AU.3
AV.1
AW.1
AY.1 (Delta)
AY.10 (Delta)
AY.100 (Delta)
AY.101 (Delta)
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AY.102.1 (Delta)
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AY.11 (Delta)
AY.110 (Delta)
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AY.112.1 (Delta)
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AY.116.1 (Delta)
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AY.119.1 (Delta)
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AY.120 (Delta)
AY.120.1 (Delta)
AY.120.2 (Delta)
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AY.121.1 (Delta)
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AY.122.1 (Delta)
AY.122.2 (Delta)
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B.1.2
B.1.201
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B.1.263
B.1.264
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B.1.350
B.1.350.1
B.1.351 (Beta)
B.1.351.1
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B.1.351.5
B.1.354
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B.1.36.21
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B.1.362.1
B.1.362.2
B.1.363
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B.1.37
B.1.370
B.1.371
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B.1.378
B.1.379
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B.1.390
B.1.391
B.1.393
B.1.395
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B.1.397
B.1.398
B.1.399
B.1.40
B.1.400
B.1.400.1
B.1.401
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B.1.411
B.1.413
B.1.415
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B.1.420
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B.1.426
B.1.427 (Epsilon)
B.1.428
B.1.428.1
B.1.428.2
B.1.428.3
B.1.429 (Epsilon)
B.1.429.1
B.1.431
B.1.432
B.1.433
B.1.434
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B.1.451
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B.1.476
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B.1.483
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B.1.490
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B.1.494
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B.1.497
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B.1.500
B.1.501
B.1.502
B.1.503
B.1.504
B.1.505
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B.1.511
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B.1.515
B.1.516
B.1.517
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B.1.520
B.1.521
B.1.523
B.1.524
B.1.525 (Eta)
B.1.526 (Iota)
B.1.527
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B.1.551
B.1.552
B.1.554
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B.1.556
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B.1.579
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B.1.581
B.1.582
B.1.585
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B.1.587
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B.1.588.1
B.1.589
B.1.590
B.1.591
B.1.592
B.1.593
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B.1.595.1
B.1.595.2
B.1.595.3
B.1.595.4
B.1.596
B.1.596.1
B.1.597
B.1.598
B.1.599
B.1.6
B.1.600
B.1.601
B.1.602
B.1.603
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B.1.609
B.1.610
B.1.611
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B.1.613
B.1.614
B.1.615
B.1.616
B.1.617
B.1.617.1 (Kappa)
B.1.617.2 (Delta)
B.1.617.3
B.1.618
B.1.619
B.1.619.1
B.1.620
B.1.621 (Mu)
B.1.621.1 (Mu)
B.1.622
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B.3
B.3.1
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B.32
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B.36
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B.40
B.41
B.42
B.43
B.44
B.45
B.46
B.47
B.49
B.5
B.50
B.51
B.52
B.53
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BA.1 (Omicron)
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BA.3 (Omicron)
BB.1
BB.2
C.1
C.1.1
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C.10
C.11
C.12
C.13
C.14
C.16
C.17
C.18
C.19
C.2
C.2.1
C.20
C.21
C.22
C.23
C.25
C.26
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C.37 (Lambda)
C.37.1 (Lambda)
C.38
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C.5
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C.7
C.8
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D.3
D.4
D.5
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K.2
K.3
L.1
L.2
L.3
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M.1
M.2
M.3
N.1
N.10
N.2
N.3
N.4
N.5
N.6
N.7
N.8
N.9
None
P.1 (Gamma)
P.1.1 (Gamma)
P.1.10 (Gamma)
P.1.10.1 (Gamma)
P.1.10.2 (Gamma)
P.1.11 (Gamma)
P.1.12 (Gamma)
P.1.12.1 (Gamma)
P.1.13 (Gamma)
P.1.14 (Gamma)
P.1.15 (Gamma)
P.1.16 (Gamma)
P.1.17 (Gamma)
P.1.17.1 (Gamma)
P.1.2 (Gamma)
P.1.3 (Gamma)
P.1.4 (Gamma)
P.1.5 (Gamma)
P.1.6 (Gamma)
P.1.7 (Gamma)
P.1.7.1 (Gamma)
P.1.8 (Gamma)
P.1.9 (Gamma)
P.2
P.3
P.4
P.5
P.6
P.7
Q.1 (Alpha)
Q.2 (Alpha)
Q.3 (Alpha)
Q.4 (Alpha)
Q.5 (Alpha)
Q.6 (Alpha)
Q.7 (Alpha)
Q.8 (Alpha)
R.1
R.2
S.1
U.1
U.2
U.3
V.1
V.2
W.1
W.2
W.3
W.4
XA
XB
XC
Y.1
Z.1

Human
African green monkey
Aonyx cinereus (Asian small-clawed otter)
Arctictis binturong (Bearcat)
Canis lupus familiaris (Dog)
Chlorocebus sabaeus (Green monkey)
Crocuta crocuta (Spotted hyena)
Environment
Felis catus (Cat)
Gorilla gorilla (Western gorilla)
Gorilla gorilla gorilla (Western lowland gorilla)
Hippopotamus amphibius (Hippo)
Humnan
Mesocricetus auratus (Syrian hamster)
Mus musculus (House mouse)
Mus musculus _balb_c mice_
Mustela furo (Ferret)
Mustela putorius furo (Ferret)
Neovison vison (American mink)
Odocoileus virginianus (White-tailed deer)
Panthera leo (Lion)
Panthera tigris (Tiger)
Panthera tigris jacksoni (Malayan tiger)
Panthera tigris sondaica (Javan tiger)
Panthera tigris tigris (Tiger)
Panthera uncia (Snow Leopard)
Prionailurus bengalensis euptilurus (Leopard cat)
Prionailurus viverrinus (fishing cat)
Puma concolor (Cougar)
Rhinolophus affinis (Intermediate horseshoe bat)
Rhinolophus bat (Lesser horseshoe bat)
Rhinolophus malayanus (Malayan horseshoe bat)
Rhinolophus marshalli (Marshall's horseshoe bat)
Rhinolophus pusillus (Least horseshoe bat)
Rhinolophus shameli (Shamel's horseshoe bat)
Rhinolophus sinicus (Chinese rufous horseshoe bat)
Rhinolophus stheno (Lesser brown horseshoe bat)
Unknown

country
state/province
city/local